中国水产科学研究院金沙澳门官网共有9个内设机构，其中职能科室4个，业务机构5个。

        职能科室分别为：办公室、人事科、财务科、科研办。

        业务机构分别为：渔业资源增殖研究室、鲆鲽类育种中心、牙鲆良种场、渤海湾环境监测站、学术交流中心。